在留資格に関する許可の種類別手数料は下記の表をご覧ください（2025年4月1日より変更がありました）。
| 許可等の種別 | 手数料 |
| 在留資格認定証明書交付 | 0円 |
| 在留資格変更許可 | 窓口6,000円、オンライン5,500円 |
| 在留期間更新許可 | 窓口6,000円、オンライン5,500円 |
| 在留資格取得許可（取得としての永住許可を含む） | 0円 |
| 永住許可（法22条の永住者への在留資格変更許可） | 10,000円（永住申請は窓口のみ） |
| 資格外活動許可 | 0円 |
| 再入国許可（1回限り） | 窓口4,000円、オンライン3,500円、 |
| 再入国許可（数次許可） | 窓口7,000円、オンライン6,500円、 |
| 就労資格証明書交付 | 1,200円 |
| 在留カードの交付（交換希望による再交付の場合） | 1,600円 |